Masjid Al-Hijrah sebagai sarana penunjang kegiatan keagamaan dan pembinaan karakter spiritual peserta didik. Masjid disediakan untuk mendukung pelaksanaan ibadah, kegiatan keagamaan, serta pembelajaran nilai-nilai religius bagi siswa, guru, dan tenaga kependidikan. Masjid dilengkapi dengan fasilitas penunjang seperti ruang salat yang luas, tempat wudu, mukena dan sajadah, Al-Qur’an, sound system, serta lingkungan yang bersih, nyaman, dan khusyuk. Suasana masjid dirancang kondusif untuk beribadah dan kegiatan keagamaan. Tempat yang nyaman bagi siswa/siswi untuk meningkatkan keimanan, ketakwaan, dan akhlak mulia.